Program Studi (Prodi) Kartografi dan Penginderaan merupakan unit pendidikan yang berdiri sejak tahun 1979 sebagai Jurusan Penginderaan Jauh. Disamping Jurusan Penginderaan Jauh, Jurusan Kartografi juga sudah berdiri sejak akhir tahun 1960-an. Pendirian Jurusan Penginderaan Jauh pada tahun 1979 adalah kelanjutan dari kerjasama nasional antara Universitas Gadjah Mada dengan Badan Koordinasi Survei dan Pemetaan Nasional (BAKOSURTANAL) mengenai pendirian PUSPICS (Pusat Pendidikan Interpretasi Citra Penginderaan Jauh dan Survei Terpadu) di tahun 1976; dimana tugas utama BAKOSURTANAL adalah inventarisasi dan evaluasi data sumberdaya alam nasional menggunakan teknologi penginderaan jauh. Kemudian, pada tahun 1985 hingga 1992 kedua Jurusan tersebut bergabung menjadi Jurusan Geografi Teknik yang membawahi Prodi Kartografi dan Prodi Penginderaan Jauh. Pada tahun 1993, kedua Prodi tersebut dilebur menjadi Prodi Kartografi dan Penginderaan Jauh (KPJ), yang bernaung di bawah Jurusan Kartografi dan Penginderaan Jauh.
Mulai tahun 1996 hingga 2002, Prodi Kartografi dan Penginderaan Jauh bersama-sama dengan tiga program studi lain di Fakultas Geografi, yaitu Geografi Fisik, Geografi Manusia, dan Perencanaan Pengembangan Wilayah dilebur menjadi satu program studi bernama program studi Geografi atas permintaan Direktorat Jenderal Pendidikan Tinggi yang mengharuskan pendidikan S1 Geografi harus disatukan di bawah satu program studi dengan nama geografi. Dalam periode itu, Kartografi dan Penginderaan Jauh menjadi salah satu minat di bawah program studi Geografi, dengan nomer SK 221/DIKTI/Kep/96. Pada tahun 1998, program studi Geografi yang antara lain membawahi Minat KPJ memperoleh akreditasi “A” dari Badan Akreditasi Nasional Perguruan Tinggi (BAN-PT) melalui SK No. 00762/Ak-I/UGMBO/VIII/1998. Pada tahun 2002, melalui surat keputusan Rektor UGM Nomor 31/P/SK/HKTI/2002, Minat Kartografi dan Penginderaan Jauh kembali memisahkan diri menjadi program studi tersendiri dengan nama program studi Kartografi dan Penginderaan Jauh yang dipakai hingga saat ini. Begitu pula halnya dengan program-program studi lain di Fakultas Geografi yang sebelumnya berupa minat.
Pada tahun 2006, sebagai perguruan tinggi dengan status Badan Hukum Milik Negara (BHMN), telah dikeluarkan SK Mendiknas No.1/2006 yang memberi kewenangan Universitas Gadjah Mada untuk menata (membuka dan menutup program studi). Menanggapi surat keputusan tersebut, pada tahun 2007, Fakultas Geografi melakukan re-organisasi internal, dan keberadaan program-program studi ditata kembali, dimana program studi Kartografi dan Penginderaan Jauh bersama-sama dengan program studi Pembangunan Wilayah bernaung di bawah jurusan baru bernama Jurusan Sains Informasi Geografi dan Pengembangan Wilayah; sementara jurusan yang lain adalah Jurusan Geografi Lingkungan yang membawahi program studi baru bernama program studi Geografi dan Ilmu Lingkungan, hasil gabungan program-program studi Geografi, Geografi Fisik, dan Geografi Manusia.
Pada tahun 2009, Program Studi Kartografi dan Penginderaan Jauh memperoleh akreditasi A dari BAN-PT dengan SK No. 031/BAN-PT/Ak-XII/S1/X/2009, yang berlaku hingga 23 Oktober 2014. Program studi ini kemudian mendapatkan re-akreditasi tangal 15 November 2014, dan mendapatkan nilai akreditasi A melalui SK BAN-PT No. 451/SK/BAN-PT/Akred/S/XI/2014, berlaku hingga 14 November 2019. Perubahan terakhir terkait status Prodi Kartografi dan Penginderaan Jauh terjadi pada bulan November 2015. Sejak saat itu pengelolaan Prodi Kartografi dan Penginderaan Jauh berada di bawah Departemen Sains Informasi Geografi, yang ditetapkan melalui SK Rektor UGM No. 1616/P/SK/HT/2015 tentang Struktur Organisasi dan Tata Kelola (SOTK) Fakultas Geografi UGM tertanggal 30 November 2015.
MASUK PTN
